КамГУ им. Витуса Беринга создает базу данных полиморфизма ДНК местных лососевых рыб, которая станет основой для борьбы с браконьерством и сохранения уникальных популяций. Молодёжная лаборатория исследования антропогенной динамики экосистем вуза получила контракт на 2,16 млн рублей для прочтения генетического кода камчатских гольцов.
Суть исследования проста: учёные отбирают образцы тканей рыб из ключевых и контрольных водоёмов Камчатки, выделяют из них ДНК и «читают» генетический код. В результате для каждой популяции формируется своего рода генетический паспорт, по которому можно определить происхождение рыбы, оценить здоровье популяции и выявить потенциальные угрозы.
По словам руководителя проекта Дарьи Паничевой, новая база данных позволит не только следить за состоянием лососевых, но и принимать обоснованные решения — от ограничения вылова в отдельных реках до усиления охраны или искусственного воспроизводства. Это особенно важно для Камчатки, где рыбные ресурсы играют ключевую роль в экономике.
Генетический анализ помогает выявить проблемы задолго до их внешних проявлений. Низкое генетическое разнообразие делает популяции уязвимыми к болезням и климатическим изменениям. Кроме того, учёные оценивают так называемую эффективную численность — сколько рыб реально участвуют в размножении. Иногда внешне многочисленная популяция оказывается генетически ослабленной, и обычный подсчёт этого не показывает.
Проект также важен для рыбоводных заводов: данные помогут понять, какие популяции уникальны и не подлежат смешиванию при разведении, чтобы сохранить местные адаптации рыб.
Из-за сложности генома лососевых учёные пошли по более экономичному пути и анализируют не весь геном целиком, а его наиболее информативные участки. Это позволяет получать достоверные данные при разумной стоимости исследований. В итоге каждый образец даёт информацию о миллионах генетических различий, по которым можно определить родство и состояние популяций.
Секвенирование проводят на современных установках Illumina и PacBio. Полученные данные станут основой для долгосрочного мониторинга. Через несколько лет учёные смогут сравнить новые образцы с текущими и точно оценить, как меняются популяции рыб.
Работа продолжится в рамках проекта «Кампус первооткрывателей» КамГУ и станет важным инструментом для сохранения и рационального использования биоресурсов Камчатки.